Taxon coverage matrix (by genus) for cluster set at subtree whose root is Cryptodira
Phylota TaxBrowser Concatenation Table
Click on cluster ID number to retrieve cluster summary and its sequences.
To trim matrix to include only taxa where Ncl and clusters where taxa per cluster ≥
Taxon (78 total) Ncl 15 30 105 106 17 164 14 109 3 23 76 16 108 142 117 18 148 141 143 354 145 13 71 24 20 247 149 144 147 21 107 392 146 19 72 25 28 35 475 81 165 251 77 64 92 245 243 231 89 60 249 80 484 22 82 476 88 242 580 84 471 355 253 483 485 232 83 59 46 94 582 31 2 79 494 8 5 246 474 41 482 56 1 286 250 248 78 62 389 49 0 7 244 230 91 575 252 53 6 472 38 233 298 93 203 204 489 487 479 488 10 477 481 470 469 239 4 697 726 728 241 486 704 574 852 698 918 61 573 68 380 699 703 473 9 478 285 27 512 321 884 509 569 26 514 508 513 510 570 851
..no NCBI genus given 4 X X     X                 X                                                                                                                                                                                                                                                                                
Actinemys 38 X X X X X         X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X                                                                 X   X   X X                     X     X                   X                                                 X                                                          
Aldabrachelys 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Amyda 7 X X   X X X X               X                                                                                                                                                                                                                                                                              
Apalone 28 X X X X X X       X X                   X           X             X     X X         X     X X   X                   X               X             X                         X                           X     X                             X             X X                     X X                      
Astrochelys 9 X X     X X X X                   X     X                                             X                                                                                                                                                                                                                    
Batagur 30 X X X X X X X X X X X X X         X       X X X   X   X X   X X X     X                             X   X               X         X                               X                                       X                                                                                                
Caretta 20 X X X X X X X X           X       X     X                                             X                   X                                                                                                 X                                                 X               X X         X         X X    
Carettochelys 19 X X X X X   X     X   X X         X     X X X X   X             X                                                                                                                                                                                         X X                                 X            
Chelonia 35 X   X X X X X X   X   X X X   X X X     X X X X X X X X X     X X       X                                 X                                                                         X                       X                                                 X               X X     X   X           X    
Chelonoidis 18 X X X   X X X X X                                   X               X     X           X         X                                                                                                                                                 X               X   X X X                                
Chelydra 45 X   X X X X X X   X   X X     X   X     X X X X   X X X X     X X X     X         X       X X   X         X X X                     X   X     X   X   X             X             X   X                           X   X         X                       X           X                         X            
Chersina 6 X X X     X X X                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Chinemys 4 X X     X                         X                                                                                                                                                                                                                                                                        
Chitra 4 X X   X X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chrysemys 74 X X X X   X   X X X X X X X X X X X X X   X X X X X X X X X   X X X     X X       X X   X X X               X X X   X           X   X   X   X X   X   X X     X     X   X X X   X             X       X X   X X X X   X         X         X X   X     X X                         X X       X   X X        
Claudius 8         X X                                         X             X                     X                   X       X                                                                                                           X                                                                          
Clemmys 16 X X   X X         X X X X   X X X   X X         X         X                                     X                                                                                                                                                                                                          
Cuora 67 X X X X X X X X X X X X X X X   X X X X X X X X   X X X X   X X X     X     X X               X   X   X X X       X   X X X X X       X X X                 X X X X   X   X             X X X   X X X     X         X   X   X     X X         X                                                           X
Cyclanorbis 6 X X X X X                               X                                                                                                                                                                                                                                                                  
Cyclemys 20 X   X X X X X X X X   X X                 X X X X X   X X   X                                                                                                                                                                                 X                                                            
Cycloderma 6 X X X X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                        
Cylindraspis 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Deirochelys 42 X X X X   X X X X X X X X   X X X   X X         X   X     X       X     X X       X X   X X X               X X X                                 X     X                   X   X     X               X X     X   X             X                       X                                                  
Dermatemys 7 X X X X X                               X           X                                                                                                                                                                                                                                                      
Dermochelys 27 X   X X X X X X   X X X X X   X   X     X X X X   X X X X     X X                                                                                                                                           X                                         X                                             X      
Dipsochelys 9 X X X   X X X X           X                                                           X                                                                                                                                                                                                                    
Dogania 13 X X   X           X X   X   X     X       X X X   X           X                                                                                                                                                                                                                                            
Emydoidea 15 X X   X X         X X X X X X X X   X X         X                                                                                                                                                                                                                                                          
Emys 36 X X X X X   X     X X X X X X X X   X X         X                     X     X                     X   X   X       X       X   X                     X           X     X       X             X                             X   X       X             X                       X           X                  
Eretmochelys 24 X   X X X X X X           X       X     X           X                     X       X       X                                     X                                       X         X X                                                                         X               X X         X     X     X    
Geochelone 25 X X X   X X X X                                     X             X X   X X         X X   X X   X             X                                         X               X       X X                   X                         X                       X                                                  
Geoclemys 10 X   X   X X X X X                                           X                                       X                             X                                                                                                                                                                        
Geoemyda 30 X X X   X X X X X                                   X       X     X   X   X X             X       X   X X   X     X     X X     X                               X X           X       X     X     X   X                                                                                                    
Glyptemys 21 X X X X X X X X X X X X X X X X X   X X         X         X                                                                                                                                                                                                                                                
Gopherus 19 X X X   X X X X X         X                                 X                         X                                                     X X               X                               X             X                                         X                               X             X      
Graptemys 32 X X X X X X   X X X X X X X X X X   X X X       X         X                     X                                                   X   X   X X               X     X     X                                                               X     X                                           X              
Hardella 25 X   X   X X X X X                                   X       X     X     X X       X X   X   X       X           X   X           X                 X   X                                                 X       X     X                                                                                    
Heosemys 54 X   X X X X X X X X   X X       X   X   X X X X X X   X X   X         X     X                     X   X X         X   X X   X         X   X     X           X   X     X                 X X     X   X     X         X   X X X X   X X X       X     X                                                   X X
Homopus 7 X X X   X X X X                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Indotestudo 14 X X X X X X X X X X             X                   X       X                                   X                                                                                                                                                                                                          
Kachuga 6 X   X     X X X X                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Kinixys 19 X X X   X X X X                                                       X X   X                     X   X X                     X       X   X                     X     X                                                               X                                                                    
Kinosternon 18       X X         X X X X         X       X X X   X   X       X X X                     X                 X                                               X                                                                                                                                                
Lepidochelys 20 X X X X X X X X           X       X     X                                                           X                             X                                                                                                                           X               X X X X     X           X    
Leucocephalon 8 X     X X X   X                                             X             X                                                                                                       X                                                                                                                        
Lissemys 9 X X X X X   X                           X                                                           X                             X                                                                                                                                                                        
Macrochelys 25 X   X X   X X X   X X X X     X   X     X X X X   X   X X     X X                               X         X                                                                                                                                               X X                                              
Malaclemys 53 X X X X X X   X X X X X X X X X X   X X         X   X     X       X     X       X X X   X X X   X           X X X   X           X                 X   X X               X   X   X     X               X X     X X X   X         X           X           X                                       X X        
Malacochersus 7 X X X     X X X                                     X                                                                                                                                                                                                                                                      
Malayemys 34 X   X   X X X X X                                           X     X   X X X       X X   X X X     X     X   X X     X     X   X       X   X     X   X   X                   X                     X                       X   X                     X                                                      
Manouria 21 X X X   X X X X   X X X X         X       X X X   X   X X   X X X                                                                                                                                                                                                                                          
Mauremys 75 X X X X X X X X X X X X X X   X X X X   X X X X X X X X X   X X X X   X   X X X               X X X   X X         X   X X X X X       X         X   X X     X   X X   X       X X       X X X   X X X     X         X   X X X     X X X                         X           X           X               X X
Melanochelys 22 X X X   X X X   X                                           X         X     X                     X   X X         X     X X X     X       X     X                 X           X                                                                                                                            
Morenia 10 X   X   X X X X X                                           X                                       X                             X                                                                                                                                                                        
Natator 10 X   X X X X X X           X       X     X                                                                                                                                                                                                                                                                  
Nilssonia 11 X X X X X X X               X                                                                       X                             X                                                                                                     X                                                                  
Notochelys 9 X   X   X   X                                               X         X     X                                     X                                                                                                           X                                                                            
Ocadia 2 X     X                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
Orlitia 11 X   X   X X X X X                                           X         X                                 X                   X                                                                                                                                                                              
Palea 10 X X X X X X X               X                                                                                                                                                                                                           X                           X                                      
Pangshura 56 X X X X X X X X X                                   X       X     X   X X X       X X   X   X     X X         X X X X X X X   X       X   X     X   X       X   X     X       X       X X X X   X X X               X   X X X X   X X X             X           X           X           X                  
Pelochelys 4 X X   X X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Pelodiscus 27 X X X X X X X X   X X   X         X     X X X X   X X         X X X       X                                                                                             X                                                                                 X X       X                         X            
Platysternon 23 X   X X X   X     X   X X     X X X X   X X X X   X X X X     X X                                         X                                                                                                                                                                                                
Psammobates 36 X X X X X X X X   X   X X       X X     X X X X X X X X X     X X X     X X         X X     X             X                                                                                                                                       X               X   X X X                                
Pseudemys 40 X X X X X X   X X X X X X X X X X   X X         X   X     X       X     X         X       X                     X               X   X   X   X X   X           X     X     X       X           X         X                                 X     X                                                          
Pyxis 10 X X     X X X X                   X     X                             X               X                                                                                                                                                                                                                    
Rafetus 5 X X X X X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Rhinoclemmys 60 X   X X X X X X X X X X X         X       X X X   X X X X   X X   X   X   X X     X X   X X     X X     X   X X X   X   X X X X                     X X X   X   X X         X X X     X     X     X   X X     X X     X                     X                               X                              
Sacalia 18 X   X X X X X   X                       X           X       X         X     X                         X           X     X   X             X                       X                                                                                                                                        
Siebenrockiella 24 X   X X X X X X X                                           X         X                           X   X X         X   X   X   X       X         X   X       X                                                                         X       X                 X                                          
Staurotypus 10 X   X X X   X   X             X   X     X                                                       X                                                                                                                                                                                                          
Sternotherus 53 X X X X X         X X X X     X   X   X X X X X   X X X X     X X X     X X       X X   X X X   X         X X X X   X           X           X     X   X X X             X   X   X                           X   X X   X                     X         X                                           X X      
Terrapene 34 X X X X X X X   X X X X X   X X X   X X         X   X     X                                     X                                   X   X   X X               X     X     X         X         X             X                             X     X     X                                                    
Testudo 83 X X X X   X X X   X X X X X       X       X X X   X X X X     X X X   X X X X     X X   X   X         X X X X X X   X X X X X X X         X       X X X X   X     X   X X   X X   X   X X X X   X X X X   X   X X X X     X X X     X       X X     X           X           X           X       X X     X X
Trachemys 39 X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X       X   X     X           X     X                             X           X     X                               X         X X                                                                     X           X X                     X X         X         X  
Trionyx 10 X X X X X                         X       X X X                                                                                                                                                                                                                     X                                      
Total taxa per cluster   76 67 62 54 53 53 52 46 34 31 30 29 29 29 27 25 22 22 22 22 21 21 20 20 19 18 18 18 17 17 17 17 17 16 15 14 13 12 12 12 12 12 12 12 11 11 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2


Back to cluster set