Taxon coverage matrix for cluster set at subtree whose root is Cryptodira
Phylota TaxBrowser Concatenation Table
Click on cluster ID number to retrieve cluster summary and its sequences. To show numbers of sequences in each cell click here.
To trim matrix to include only taxa where Ncl and clusters where taxa per cluster ≥
Taxon (414 total) Ncl 15 14 105 17 30 106 164 109 108 3 18 16 23 13 107 24 20 142 19 25 117 141 143 148 21 145 76 144 147 22 354 149 146 71 508 247 72 392 251 569 27 35 81 355 92 77 64 570 28 245 580 231 475 165 89 60 82 249 80 482 484 243 476 242 84 582 2 494 8 483 5 1 575 88 250 59 46 884 471 0 253 485 7 232 83 6 94 248 31 389 285 79 487 479 246 10 477 474 481 41 56 469 286 53 78 62 489 49 574 244 488 230 91 573 470 252 851 9 38 472 4 512 233 298 93 203 204 704 486 509 852 514 513 510 239 703 697 726 728 321 241 698 26 918 61 68 380 699 473 478
Actinemys marmorata 38 X X X X X         X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X                                                                 X   X   X X                     X     X                   X                                                 X                                                          
Aldabrachelys grandidieri 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Amyda cartilaginea 7 X X   X X X X               X                                                                                                                                                                                                                                                                              
Apalone ferox 22 X X   X X X         X                               X             X     X X         X     X X   X                   X                             X                         X                           X     X                             X             X X                                              
Apalone mutica 7 X X   X   X         X                                                                                                                                                                                                                                                             X X                      
Apalone spinifera 8 X   X X   X       X X                   X                                                                                           X                                                                                                                                                                      
Apalone spinifera aspera 5 X X   X   X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Apalone spinifera ater 5 X     X   X         X                   X                                                                                                                                                                                                                                                                  
Apalone spinifera emoryi 5 X X   X   X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Apalone spinifera guadalupensis 3       X   X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Apalone spinifera hartwegi 4 X     X   X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Apalone spinifera pallida 4 X     X   X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Apalone spinifera spinifera 4 X     X   X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Astrochelys radiata 9 X X     X X X X                   X     X                                             X                                                                                                                                                                                                                    
Astrochelys yniphora 7 X X     X X X X                                                                       X                                                                                                                                                                                                                    
Batagur affinis 3 X   X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                              
Batagur baska 10 X   X   X X X X X                                                                                       X               X                                                                                 X                                                                                                
Batagur borneoensis 10 X   X   X X X X X                                           X         X                                                                                           X                                                                                                                                        
Batagur dhongoka 11 X X X   X X X X X                                           X                                       X                             X                                                                                                                                                                        
Batagur kachuga 8 X X X   X X X                                                                                       X                             X                                                                                                                                                                        
Batagur sp. AA1001 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Batagur sp. AA1002 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Batagur sp. AA1003 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Batagur sp. AA1004 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Batagur sp. AA1014 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Batagur sp. AA1015 3 X             X X                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Batagur sp. AA1016 4 X   X     X X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Batagur trivittata 15       X X         X X X X         X       X X X   X   X X     X X                                                                                                                                                                                                                                          
Caretta caretta 20 X X X X X X X X           X       X     X                                             X                   X                                                                                                 X                                                 X               X X         X         X X    
Caretta caretta x Lepidochelys kempii 1                           X                                                                                                                                                                                                                                                                                
Carettochelys insculpta 19 X X X X X   X     X   X X         X     X X X X   X             X                                                                                                                                                                                         X X                                 X            
Chelonia mydas 34 X   X X X X X X   X   X X     X X X     X X X X X X X X X     X X       X                                 X                                                                         X                       X                                                 X               X X     X   X           X    
Chelonia mydas agassizii 1                           X                                                                                                                                                                                                                                                                                
Chelonoidis abingdonii 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis becki 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis carbonaria 14 X X X     X X X X                                                   X                           X                                                                                                                                                 X               X   X X X                                
Chelonoidis chathamensis 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis chilensis 14 X X X   X X X X X                                                   X                                                                                                                                                                             X               X   X X X                                
Chelonoidis chilensis donosobarrosi 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Chelonoidis chilensis petersi 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Chelonoidis darwini 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis denticulata 15 X X X   X X X X X                                   X                     X                                                                                                                                                                       X               X   X X X                                
Chelonoidis duncanensis 2 X                                                                   X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis hoodensis 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis nigra 14 X X X   X X X X                                                     X                 X                                                                                                                                                           X               X   X X X                                
Chelonoidis nigra galapagoensis 1                                                                     X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis nigra nigrita 2   X                                                                 X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis phantastica 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis porteri 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis sp. 8134 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis sp. 8143 2             X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis sp. 8145 2 X                                                                   X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis sp. 8146 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis sp. 8148 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis vicina 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelonoidis wallacei 1                                                                     X                                                                                                                                                                                                                                      
Chelydra rossignonii 1         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chelydra serpentina 44 X   X X   X X X   X   X X     X   X     X X X X   X X X X     X X X     X         X       X X   X         X X X                     X   X     X   X   X             X             X   X                           X   X         X                       X           X                         X            
Chersina angulata 6 X X X     X X X                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Chinemys nigricans 3 X X     X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chinemys reevesi 1                                   X                                                                                                                                                                                                                                                                        
Chitra chitra 4 X X   X X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chitra indica 4 X X   X X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chitra sp. Myanmar 1   X                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
Chitra vandijki 2 X     X                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
Chrysemys picta 56 X X   X           X X X X X     X X X     X X X X X X X X     X X X     X X       X X   X X X               X X X   X           X                 X   X X               X   X   X                     X X   X X X X   X         X           X         X X                         X X       X   X X        
Chrysemys picta bellii 12                   X       X                                                                                                         X   X   X X               X     X     X                   X                                           X     X                                                          
Chrysemys picta dorsalis 20 X X X X   X   X X X       X X                                                                                                       X   X   X X               X     X     X                   X                                           X     X                                                          
Chrysemys picta marginata 9 X X   X                 X X X X       X                   X                                                                                                                                                                                                                                                
Chrysemys picta picta 1                           X                                                                                                                                                                                                                                                                                
Claudius angustatus 8         X X                                         X             X                     X                   X       X                                                                                                           X                                                                          
Clemmys guttata 16 X X   X X         X X X X   X X X   X X         X         X                                     X                                                                                                                                                                                                          
Cuora amboinensis 56 X X X X X X X X X X X X         X X X   X X X X   X   X X     X X     X     X X               X   X   X X X       X   X X   X X       X   X                 X   X X   X                 X X     X X X     X         X   X   X     X X         X                                                           X
Cuora amboinensis amboinensis 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Cuora amboinensis couro 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Cuora amboinensis kamaroma 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Cuora amboinensis lineata 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Cuora aurocapitata 24 X X X X X   X     X X X         X X X   X X X X   X   X X   X X X             X               X                                                                                                                                                                                                            
Cuora bourreti 19   X   X X         X X X         X X X     X X X   X   X X     X X             X               X                                                                                                                                                                                                            
Cuora flavomarginata 25 X X X X X   X     X X X X   X   X X X X   X X X   X   X X     X X             X               X                                                                                                                                                                                                            
Cuora flavomarginata evelynae 4 X   X       X                                               X                                                                                                                                                                                                                                              
Cuora flavomarginata flavomarginata 2     X       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Cuora flavomarginata sinensis 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
Cuora galbinifrons 24 X X X X X X X   X X X X         X X X     X X X   X   X X     X X             X               X                                                                                                                                                                                                            
Cuora mccordi 20 X X   X X         X X X         X X X     X X X   X   X X     X X             X               X                                                                                                                                                                                                            
Cuora mouhotii 27 X X X X X   X     X X X   X       X