Taxon coverage matrix for cluster set at subtree whose root is Testudines
Phylota TaxBrowser Concatenation Table
Click on cluster ID number to retrieve cluster summary and its sequences. To show numbers of sequences in each cell click here.
To trim matrix to include only taxa where Ncl and clusters where taxa per cluster ≥
Taxon (502 total) Ncl 13 4 12 5 14 1 3 0 83 35 118 117 123 116 201 86 124 120 119 125 213 252 121 257 39 254 253 256 212 466 122 255 6 169 663 406 10 517 410 37 87 734 38 127 735 404 162 467 173 188 128 134 177 9 634 726 390 178 176 643 641 36 185 408 401 107 402 635 730 109 106 642 409 184 145 653 180 738 158 111 407 190 11 2 110 412 1034 391 179 88 644 105 630 633 175 140 646 636 485 113 152 405 638 640 155 130 628 518 44 148 728 137 648 389 727 112 187 160 629 43 647 108 174 631 403 219 1042 411 398 882 667 665 495 664 669 999 189 668 645 883 392 400 316 313 294 101 320 876 314 307 126 159 598 637 433 297 299 632 295 929 302 312 306 877 309 315 166 300 310 303 305 308 878 927 318 301 317 493
Acanthochelys macrocephala 3 X X   X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Acanthochelys pallidipectoris 7 X X X X   X X                                                   X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Acanthochelys radiolata 4 X X   X     X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Acanthochelys spixii 3 X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Actinemys marmorata 38 X X X X X       X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X   X                                                       X       X       X X                 X         X                             X                                           X                                                                                                                
Aldabrachelys grandidieri 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Amyda cartilaginea 7 X X   X X X X               X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Apalone ferox 22 X X   X X X         X                           X                 X     X X                 X   X   X   X           X                             X               X                                     X       X       X     X               X                                                                                                                    
Apalone mutica 7 X X     X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                         X                           X        
Apalone spinifera 8 X   X   X X     X X X                                                                                                             X                                                                                                                                                                                                                                
Apalone spinifera aspera 5 X X     X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Apalone spinifera ater 5 X       X X     X   X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Apalone spinifera emoryi 5 X X     X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Apalone spinifera guadalupensis 3         X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Apalone spinifera hartwegi 4 X       X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Apalone spinifera pallida 4 X       X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Apalone spinifera spinifera 4 X       X X         X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Astrochelys radiata 9 X X   X   X X X X             X                                                               X                                                                                                                                                                                                                                                                    
Astrochelys yniphora 7 X X   X   X X X                                                                               X                                                                                                                                                                                                                                                                    
Batagur affinis 3 X   X                                                     X                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
Batagur baska 10 X   X X   X X X X                                                                                           X         X                                                                                             X                                                                                                                                              
Batagur borneoensis 10 X   X X   X X X X                                         X           X                                                                                                             X                                                                                                                                                                              
Batagur dhongoka 11 X X X X   X X X X                                         X                                                   X                         X                                                                                                                                                                                                                          
Batagur kachuga 8 X X X X   X X                                                                                                 X                         X                                                                                                                                                                                                                          
Batagur sp. AA1001 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Batagur sp. AA1002 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Batagur sp. AA1003 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Batagur sp. AA1004 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Batagur sp. AA1014 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Batagur sp. AA1015 3 X             X X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Batagur sp. AA1016 4 X   X     X X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
Batagur trivittata 15       X X         X X X X     X         X X   X   X X X X     X                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
Caretta caretta 20 X X X X X X X X X         X   X                                               X               X                                                                                                     X                                                             X                   X               X                               X                 X         X
Caretta caretta x Lepidochelys kempii 1                           X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
Carettochelys insculpta 39 X X X X X   X   X X   X X     X         X X   X   X           X                                                                                                                                                         X                     X           X                                 X X     X   X X             X   X   X X X   X X   X X X X X     X X X  
Chelodina longicollis 9 X   X   X   X   X                                               X       X                                 X                                                         X                                                                                                                                                                                              
Chelodina mccordi 1       X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Chelodina novaeguineae 2       X                                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                    
Chelodina oblonga 5     X X   X X                                                   X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chelodina pritchardi 1       X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Chelodina reimanni 1       X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Chelodina rugosa 6     X X X X X                                                   X                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chelodina siebenrocki 4     X       X                                                                                                                                                                                                           X                     X                                                                                                                    
Chelonia mydas 34 X   X X X X X X X X   X X     X X X     X X X X X X X X X     X         X     X                                                                                                                     X                 X                                           X                   X               X             X                 X                 X          
Chelonia mydas agassizii 1                           X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
Chelonoidis abingdonii 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis becki 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis carbonaria 14 X X X     X X X X                                                   X                               X                                                                                                                                                               X X   X X     X                                                                                
Chelonoidis chathamensis 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis chilensis 14 X X X X   X X X X                                                   X                                                                                                                                                                                               X X   X X     X                                                                                
Chelonoidis chilensis donosobarrosi 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chelonoidis chilensis petersi 1 X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
Chelonoidis darwini 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis denticulata 15 X X X X   X X X X                               X                         X                                                                                                                                                                                         X X   X X     X                                                                                
Chelonoidis duncanensis 2 X                                                                   X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis hoodensis 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis nigra 14 X X X X   X X X                                                     X                         X                                                                                                                                                                     X X   X X     X                                                                                
Chelonoidis nigra galapagoensis 1                                                                     X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis nigra nigrita 2   X                                                                 X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis phantastica 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis porteri 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis sp. 8134 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis sp. 8143 2             X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis sp. 8145 2 X                                                                   X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis sp. 8146 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis sp. 8148 3 X           X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis vicina 4 X X         X                                                       X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelonoidis wallacei 1                                                                     X                                                                                                                                                                                                                                                                                              
Chelus fimbriata 12 X X X X X X X   X X                                             X             X                                           X                                                                                                                                                                                                                                        
Chelydra rossignonii 1       X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
Chelydra serpentina 47 X   X   X X X X X X   X X     X X       X X   X X X X X X     X   X     X     X X           X   X   X X   X               X X     X         X     X         X X     X                       X                             X             X X               X                   X X                 X             X                                                  
Chersina angulata 7 X X X     X X X